Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Myo5cE9Q1F5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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