Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms