Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms