Protein–RNA interactions for Protein: E9PY60

Vmn1r77, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r77E9PY60 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r77E9PY60 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r77E9PY60 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms