Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r177E9PXM3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r177E9PXM3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms