Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms