Protein–RNA interactions for Protein: E9PWI7

C87414, Expressed sequence C87414, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87414E9PWI7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C87414E9PWI7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms