Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc8E9PWG2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trappc8E9PWG2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms