Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gimd1E9PW74 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gimd1E9PW74 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms