Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc62E9PVD1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms