Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms