Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FgaE9PV24 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgaE9PV24 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms