Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms