Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Soga1E1U8D0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Soga1E1U8D0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms