Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms