Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm6685D3YYP3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm6685D3YYP3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm6685D3YYP3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm6685D3YYP3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm6685D3YYP3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm6685D3YYP3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm6685D3YYP3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm6685D3YYP3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm6685D3YYP3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm6685D3YYP3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm6685D3YYP3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6685D3YYP3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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