Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms