Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms