Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc8B2RUS7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms