Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms