Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms