Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms