Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms