Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spocd1B1ASB6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms