Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem235B1AQL3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem235B1AQL3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms