Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox1B1APN4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox1B1APN4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox1B1APN4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox1B1APN4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox1B1APN4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox1B1APN4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox1B1APN4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox1B1APN4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox1B1APN4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhox1B1APN4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhox1B1APN4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhox1B1APN4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhox1B1APN4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhox1B1APN4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhox1B1APN4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox1B1APN4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms