Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp4A4UUI3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms