Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf2A3KGV1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms