Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms