Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf39A2RT81 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms