Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms