Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Klhl41A2AUC9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms