Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms