Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms