Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

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Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm5938A2AEN9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm5938A2AEN9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm5938A2AEN9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm5938A2AEN9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm5938A2AEN9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm5938A2AEN9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm5938A2AEN9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm5938A2AEN9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm5938A2AEN9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm5938A2AEN9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm5938A2AEN9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm5938A2AEN9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5938A2AEN9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5938A2AEN9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5938A2AEN9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5938A2AEN9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5938A2AEN9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5938A2AEN9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5938A2AEN9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5938A2AEN9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms