Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms