Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1bA1Z198 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms