Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms