Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
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