Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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