Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trbv31A0A075B5J5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trbv31A0A075B5J5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Trbv31A0A075B5J5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Trbv31A0A075B5J5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Trbv31A0A075B5J5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv31A0A075B5J5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Trbv31A0A075B5J5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Trbv31A0A075B5J5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Trbv31A0A075B5J5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trbv31A0A075B5J5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trbv31A0A075B5J5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trbv31A0A075B5J5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trbv31A0A075B5J5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trbv31A0A075B5J5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Trbv31A0A075B5J5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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