Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lgr5Q9Z1P4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lgr5Q9Z1P4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lgr5Q9Z1P4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lgr5Q9Z1P4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Lgr5Q9Z1P4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lgr5Q9Z1P4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lgr5Q9Z1P4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lgr5Q9Z1P4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lgr5Q9Z1P4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lgr5Q9Z1P4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lgr5Q9Z1P4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lgr5Q9Z1P4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lgr5Q9Z1P4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Lgr5Q9Z1P4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Lgr5Q9Z1P4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lgr5Q9Z1P4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Lgr5Q9Z1P4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lgr5Q9Z1P4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lgr5Q9Z1P4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Lgr5Q9Z1P4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lgr5Q9Z1P4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lgr5Q9Z1P4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lgr5Q9Z1P4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lgr5Q9Z1P4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Lgr5Q9Z1P4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lgr5Q9Z1P4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Lgr5Q9Z1P4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lgr5Q9Z1P4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Lgr5Q9Z1P4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Lgr5Q9Z1P4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lgr5Q9Z1P4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Lgr5Q9Z1P4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lgr5Q9Z1P4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lgr5Q9Z1P4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Lgr5Q9Z1P4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lgr5Q9Z1P4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lgr5Q9Z1P4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lgr5Q9Z1P4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lgr5Q9Z1P4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lgr5Q9Z1P4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lgr5Q9Z1P4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lgr5Q9Z1P4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lgr5Q9Z1P4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lgr5Q9Z1P4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lgr5Q9Z1P4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lgr5Q9Z1P4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lgr5Q9Z1P4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lgr5Q9Z1P4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms