Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnbip1Q9JJN6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnnbip1Q9JJN6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnbip1Q9JJN6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms