Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg9Q9DB90 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smg9Q9DB90 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smg9Q9DB90 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg9Q9DB90 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg9Q9DB90 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg9Q9DB90 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg9Q9DB90 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg9Q9DB90 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smg9Q9DB90 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg9Q9DB90 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg9Q9DB90 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg9Q9DB90 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg9Q9DB90 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smg9Q9DB90 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smg9Q9DB90 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smg9Q9DB90 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Smg9Q9DB90 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smg9Q9DB90 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smg9Q9DB90 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg9Q9DB90 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smg9Q9DB90 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smg9Q9DB90 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smg9Q9DB90 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg9Q9DB90 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg9Q9DB90 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg9Q9DB90 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg9Q9DB90 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg9Q9DB90 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg9Q9DB90 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg9Q9DB90 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg9Q9DB90 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg9Q9DB90 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg9Q9DB90 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg9Q9DB90 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg9Q9DB90 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg9Q9DB90 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smg9Q9DB90 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
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