Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Nol3Q9D1X0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nol3Q9D1X0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nol3Q9D1X0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nol3Q9D1X0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nol3Q9D1X0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nol3Q9D1X0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nol3Q9D1X0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nol3Q9D1X0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nol3Q9D1X0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nol3Q9D1X0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nol3Q9D1X0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nol3Q9D1X0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nol3Q9D1X0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nol3Q9D1X0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nol3Q9D1X0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nol3Q9D1X0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nol3Q9D1X0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nol3Q9D1X0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nol3Q9D1X0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nol3Q9D1X0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms