Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D131 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D131 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D131 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D131 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q9D131 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D131 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D131 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D131 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D131 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D131 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D131 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D131 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D131 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D131 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D131 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D131 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D131 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D131 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D131 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D131 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D131 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D131 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D131 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D131 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D131 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D131 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D131 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D131 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D131 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D131 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D131 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D131 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D131 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D131 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D131 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D131 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D131 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D131 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D131 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D131 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D131 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D131 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D131 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D131 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D131 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D131 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D131 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D131 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D131 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D131 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D131 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D131 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D131 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D131 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D131 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D131 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D131 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D131 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D131 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D131 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D131 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D131 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D131 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D131 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D131 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D131 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D131 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D131 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D131 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D131 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D131 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D131 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D131 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D131 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D131 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D131 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D131 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D131 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D131 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D131 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D131 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D131 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D131 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D131 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D131 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D131 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9D131 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D131 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D131 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D131 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D131 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D131 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D131 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D131 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D131 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D131 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D131 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D131 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D131 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms