Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Atg3Q9CPX6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Atg3Q9CPX6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Atg3Q9CPX6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Atg3Q9CPX6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Atg3Q9CPX6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Atg3Q9CPX6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Atg3Q9CPX6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Atg3Q9CPX6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Atg3Q9CPX6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Atg3Q9CPX6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Atg3Q9CPX6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Atg3Q9CPX6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Atg3Q9CPX6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Atg3Q9CPX6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Atg3Q9CPX6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Atg3Q9CPX6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Atg3Q9CPX6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Atg3Q9CPX6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Atg3Q9CPX6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Atg3Q9CPX6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Atg3Q9CPX6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Atg3Q9CPX6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Atg3Q9CPX6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Atg3Q9CPX6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Atg3Q9CPX6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Atg3Q9CPX6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Atg3Q9CPX6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Atg3Q9CPX6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Atg3Q9CPX6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Atg3Q9CPX6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Atg3Q9CPX6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Atg3Q9CPX6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Atg3Q9CPX6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Atg3Q9CPX6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Atg3Q9CPX6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Atg3Q9CPX6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Atg3Q9CPX6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Atg3Q9CPX6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Atg3Q9CPX6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Atg3Q9CPX6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Atg3Q9CPX6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Atg3Q9CPX6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Atg3Q9CPX6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Atg3Q9CPX6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Atg3Q9CPX6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Atg3Q9CPX6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Atg3Q9CPX6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Atg3Q9CPX6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Atg3Q9CPX6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Atg3Q9CPX6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Atg3Q9CPX6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Atg3Q9CPX6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Atg3Q9CPX6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Atg3Q9CPX6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Atg3Q9CPX6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Atg3Q9CPX6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Atg3Q9CPX6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Atg3Q9CPX6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Atg3Q9CPX6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Atg3Q9CPX6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Atg3Q9CPX6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Atg3Q9CPX6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Atg3Q9CPX6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Atg3Q9CPX6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Atg3Q9CPX6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Atg3Q9CPX6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Atg3Q9CPX6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Atg3Q9CPX6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Atg3Q9CPX6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms