Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Grin3bQ91ZU9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Grin3bQ91ZU9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Grin3bQ91ZU9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Grin3bQ91ZU9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Grin3bQ91ZU9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26,45■■□□□ 1,83
Grin3bQ91ZU9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26,45■■□□□ 1,82
Grin3bQ91ZU9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Grin3bQ91ZU9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Grin3bQ91ZU9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Grin3bQ91ZU9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Grin3bQ91ZU9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Grin3bQ91ZU9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Grin3bQ91ZU9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Grin3bQ91ZU9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Grin3bQ91ZU9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Grin3bQ91ZU9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Grin3bQ91ZU9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Grin3bQ91ZU9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Grin3bQ91ZU9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26,4■■□□□ 1,82
Grin3bQ91ZU9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Grin3bQ91ZU9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Grin3bQ91ZU9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Grin3bQ91ZU9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Grin3bQ91ZU9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Grin3bQ91ZU9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Grin3bQ91ZU9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Grin3bQ91ZU9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Grin3bQ91ZU9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Grin3bQ91ZU9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Grin3bQ91ZU9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Grin3bQ91ZU9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Grin3bQ91ZU9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Grin3bQ91ZU9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Grin3bQ91ZU9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Grin3bQ91ZU9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Grin3bQ91ZU9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Grin3bQ91ZU9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Grin3bQ91ZU9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Grin3bQ91ZU9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Grin3bQ91ZU9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26,32■■□□□ 1,8
Grin3bQ91ZU9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Grin3bQ91ZU9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Grin3bQ91ZU9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Grin3bQ91ZU9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Grin3bQ91ZU9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26,29■■□□□ 1,8
Grin3bQ91ZU9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Grin3bQ91ZU9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Grin3bQ91ZU9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Grin3bQ91ZU9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Grin3bQ91ZU9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Grin3bQ91ZU9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Grin3bQ91ZU9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Grin3bQ91ZU9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26,27■■□□□ 1,8
Grin3bQ91ZU9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Grin3bQ91ZU9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Grin3bQ91ZU9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Grin3bQ91ZU9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Grin3bQ91ZU9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Grin3bQ91ZU9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Grin3bQ91ZU9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Grin3bQ91ZU9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Grin3bQ91ZU9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Grin3bQ91ZU9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Grin3bQ91ZU9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Grin3bQ91ZU9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Grin3bQ91ZU9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Grin3bQ91ZU9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Grin3bQ91ZU9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Grin3bQ91ZU9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Grin3bQ91ZU9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Grin3bQ91ZU9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Grin3bQ91ZU9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Grin3bQ91ZU9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Grin3bQ91ZU9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Grin3bQ91ZU9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Grin3bQ91ZU9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Grin3bQ91ZU9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Grin3bQ91ZU9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Grin3bQ91ZU9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Grin3bQ91ZU9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Grin3bQ91ZU9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26,14■■□□□ 1,78
Grin3bQ91ZU9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Grin3bQ91ZU9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Grin3bQ91ZU9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26,12■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,5 ms