Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab4bQ91ZR1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab4bQ91ZR1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab4bQ91ZR1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab4bQ91ZR1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab4bQ91ZR1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab4bQ91ZR1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab4bQ91ZR1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab4bQ91ZR1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab4bQ91ZR1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab4bQ91ZR1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab4bQ91ZR1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab4bQ91ZR1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab4bQ91ZR1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab4bQ91ZR1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab4bQ91ZR1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab4bQ91ZR1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab4bQ91ZR1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab4bQ91ZR1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab4bQ91ZR1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab4bQ91ZR1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab4bQ91ZR1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab4bQ91ZR1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms