Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Trpm2Q91YD4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Trpm2Q91YD4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Trpm2Q91YD4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Trpm2Q91YD4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Trpm2Q91YD4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Trpm2Q91YD4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Trpm2Q91YD4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Trpm2Q91YD4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Trpm2Q91YD4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Trpm2Q91YD4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Trpm2Q91YD4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Trpm2Q91YD4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Trpm2Q91YD4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
Trpm2Q91YD4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Trpm2Q91YD4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Trpm2Q91YD4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Trpm2Q91YD4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Trpm2Q91YD4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Trpm2Q91YD4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Trpm2Q91YD4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Trpm2Q91YD4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Trpm2Q91YD4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Trpm2Q91YD4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Trpm2Q91YD4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Trpm2Q91YD4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Trpm2Q91YD4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Trpm2Q91YD4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Trpm2Q91YD4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Trpm2Q91YD4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Trpm2Q91YD4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Trpm2Q91YD4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Trpm2Q91YD4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Trpm2Q91YD4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Trpm2Q91YD4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Trpm2Q91YD4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Trpm2Q91YD4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Trpm2Q91YD4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Trpm2Q91YD4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Trpm2Q91YD4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Trpm2Q91YD4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Trpm2Q91YD4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Trpm2Q91YD4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Trpm2Q91YD4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trpm2Q91YD4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Trpm2Q91YD4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Trpm2Q91YD4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Trpm2Q91YD4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Trpm2Q91YD4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Trpm2Q91YD4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Trpm2Q91YD4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Trpm2Q91YD4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Trpm2Q91YD4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Trpm2Q91YD4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Trpm2Q91YD4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Trpm2Q91YD4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Trpm2Q91YD4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Trpm2Q91YD4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Trpm2Q91YD4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Trpm2Q91YD4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Trpm2Q91YD4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Trpm2Q91YD4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
Trpm2Q91YD4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Trpm2Q91YD4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Trpm2Q91YD4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Trpm2Q91YD4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Trpm2Q91YD4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Trpm2Q91YD4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Trpm2Q91YD4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Trpm2Q91YD4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Trpm2Q91YD4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Trpm2Q91YD4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Trpm2Q91YD4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Trpm2Q91YD4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Trpm2Q91YD4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Trpm2Q91YD4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Trpm2Q91YD4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Trpm2Q91YD4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Trpm2Q91YD4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Trpm2Q91YD4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Trpm2Q91YD4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Trpm2Q91YD4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Trpm2Q91YD4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Trpm2Q91YD4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Trpm2Q91YD4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Trpm2Q91YD4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Trpm2Q91YD4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Trpm2Q91YD4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Trpm2Q91YD4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Trpm2Q91YD4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Trpm2Q91YD4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Trpm2Q91YD4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Trpm2Q91YD4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Trpm2Q91YD4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Trpm2Q91YD4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Trpm2Q91YD4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Trpm2Q91YD4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Trpm2Q91YD4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Trpm2Q91YD4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.18
Trpm2Q91YD4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms